(1)假道形成
　　多因通过狭窄部困难时，导丝由胆道壁通过而形成，若能及时发现并撤出导丝，假道可自行闭塞。一旦已行球囊扩张或置入支架则可造成胆道进一步阻塞。假道与腹腔相通时，可形成胆汁腹腔瘘，需手术处理。
　　(2)胰腺炎
　　当置入的支架或内涵管阻塞胰腺管开口时可发生胰腺炎。采用网状支架其发生率极低。所以狭窄部位于胰腺管开口附近时，尽量不采用内阁管及螺旋状支架。
　　(3)支架移位
　　由于正常胆管有一定的收缩蠕动能力，置入物可能发生游移，通常向下入十二指肠内，内涵管移位的发生率较支架高。一旦发生置入物移位，可另发置一支架。游离入肠道的置入物常可经肛门排出。
　　(4)通道再狭窄及闭塞
　　肿瘤不断生长可进入重建的管道内造成胆道再狭窄或闭塞。网状支架置入后半年再狭窄的发生率可达30％左右，可再行支架置入术，常用直径较原支架较小的支架行内支撑。内涵管阻塞多由胆石、粘稠的胆汁或肿瘤生长超过内内涵管覆盖范围所致。在本术后进行有效的抗肿瘤治疗，如肝动脉内化疗药物灌注术和内照射治疗等，可防止或延缓通道再狭窄的发生。
　　(5)胆道出血
　　由于需行胆管扩张及支架置入，胆道出血的发生率较PTCD高，可达40％。而支架及内涵管置入后，对局部起压迫止血作用，一般出血可自行停止。